java.lang.Object
- CSpider2

```
public class CSpider2
extends java.lang.Object
```
2021.07.11 spider2アルゴリズムJAVA版
コアと拡張後の直方体を非相似に対応するために、
parametersファイルコアのx-方向の比率(xCoreRatio)を追加
xCoreratioが書かれているとcuboidを書き直す＜==よくわからないので使用しない。
2021.07.04
2.vs.1対応
parameters file
Cuboid x y z は最小値を設定する。
例　x: 0 70
y: -40 40
z: -45 45
の場合　cuboid　=35 ,35 ,35
2021.05.24
pointsファイルを呼び込んで、コアとの距離を急に離れないように
調整して、pointsファイルに書き込む。

2021.04.16
蜘蛛の巣アルゴリズム（岩上さん）のJAVA版を実装
doExpansion

作成者:

ohno

フィールドの概要

フィールド
修飾子とタイプ	フィールド	説明
`private sde.to.model.CTS`	`alpha_val`
`private CBadCellSampleList`	`badList`
`(package private) java.io.BufferedReader`	`buff`
`private double`	`delta_x`	x-方向のセルの長さ= (max_x - min_x)/
`private double`	`delta_y`
`private double`	`delta_z`
`private sde.to.model.CTS`	`diff_x`	ポイント情報のx座標を格納する。
`private sde.to.model.CTS`	`diff_y`
`private sde.to.model.CTS`	`diff_z`
`private java.lang.String`	`infname`
`private java.lang.String`	`infpath`
`private java.lang.String`	`inParameterFile`
`private boolean`	`isDistortionCalcurate`
`private boolean`	`isPointsSave`
`private boolean`	`isRatioCalcurate`
`private java.lang.String`	`outfname`
`private java.lang.String`	`outfpath`
`(package private) java.io.File`	`paramfile`
`private sde.to.model.CTS[]`	`points`
`private java.lang.String[]`	`Points_Header`
`private int`	`points_header_line_no`
`(package private) int`	`points_no`
`(package private) java.io.File`	`pointsfile`
`(package private) java.io.FileReader`	`reader`
`(package private) java.io.PrintWriter`	`writefile`

コンストラクタの概要

コンストラクタ
コンストラクタ	説明
`CSpider2(double delta_x, double delta_y, double delta_z)`	CellPaire から　doExpansionを呼ぶ時に使用されるコンストラクタ
`CSpider2(java.lang.String infpath, java.lang.String infname, java.lang.String inParameterFile, java.lang.String outpath, java.lang.String outfname)`	コンストラクタ

メソッドの概要

すべてのメソッド staticメソッドインスタンス・メソッド concreteメソッド
修飾子とタイプ	メソッド	説明
`private void`	`changeCuvoid()`	xCoreRatioが設定されている場合 Cu = max {\|min - p0\|_max , \|max - p0\|_max} Cuboid_.x = Cu * xCoreRatio Cuboid_.y = Cu Cuboid_.z = Cu CPA.cuboid=Cuboid_
`private void`	`checkParam()`	パラメータの検証
`private void`	`doCalculateCellsDistortion(java.lang.String badCellPointsFilePath)`	歪度を各点すべてに計算する。
`private void`	`doCalculateCellsRatio(java.lang.String badCellPointsFilePath)`	歪度を各点すべてに計算する。
`(package private) Cell`	`doExpansion(Cell cell)`	Cellの拡張　蜘蛛の巣処理 CellPairで使用
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`doExpansion(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	pointの拡張　蜘蛛の巣処理原点とのオフセット・正規化、拡張係数による拡大、正規化の戻し＋原点のリセット β(\|(p-p0)/cuboid\|max) ((p-p0)/cuboid)+p0
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`doExpansionNoCube(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	pointの拡張（非立方体） p_p0/cuboid _x ＜ 0 のとき \|p_p0/cuboid\|_max ＞ \|getMinValueP_P0DividedByCuboid\|であればｘ方向の倍率はα_xを用いる。
`private double`	`expansionRate(double mx, double x, int id)`	x-方向の拡大係数 α_xを計算する。
`private double`	`expansionRate_linea(double x)`	拡大率の計算オリジナル
`private double`	`expansionRate2(double x)`	拡大率の計算　２次曲線　2021.05.04
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector[]`	`get3CellPoints(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	get3CellPoints
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`get3dRealVector(double x, double y, double z)`	getRealVector
`private double`	`getExpansionFactor(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	拡張係数のみを計算する。
`(package private) int[]`	`getIdxFromKey(int key)`	key 情報から(i,j,k)情報を返す。
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`getMaxValueP_P0DividedByCuboid()`	p_p0\|x/cuboid_x ...
`private org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`getMinValueP_P0DividedByCuboid()`	p_p0\|x/cuboid_x ...の最小値を求める
`(package private) org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`getPointFromKey(int key)`	distortion mapのkey 情報から点情報を返す。
`(package private) void`	`inFileOpen()`	入力ファイルのオープン
`static void`	`main(java.lang.String[] arg)`	main
`private double`	`max_abs(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	\|p\|_max = max(\|x\|,\|y\|,\|z\|)
`(package private) void`	`outFileOpen()`	出力ファイルのオープン
`(package private) void`	`parameterFileOpen()`	パラメータファイルのオープン
`(package private) org.apache.commons.math3.linear.RealVector`	`parse3(java.lang.String oneline)`	oneline = (px,py,pz)の読み込み上の形でないときにはnullを返す。
`(package private) void`	`parseCuboid(java.lang.String oneline)`	oneline = cuboid:(px,py,pz)の読み込み上の形でないときにはnullを返す。
`(package private) void`	`parseOrigin(java.lang.String oneline)`	oneline = p0:(px,py,pz)の読み込み上の形でないときにはnullを返す。
`(package private) int`	`parsePointNo(java.lang.String oneline)`	点数上の形でないときは-1をかえす。
`private boolean`	`parseValue(java.lang.String oneline)`	oneline = xx:実数の読み込み xx gamma1 or gamma2 or beta or minX or maxX or minY or maxY or minZ or maxZ or divX or divY or divZ 上の形でないときにはfalseを返す。
`private void`	`pointsReadWrite()`	ポイントデータの入力拡張処理ポイントデータの出力 Spider2 メイン処理
`(package private) void`	`print(java.lang.String name, org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)`	print Point　点情報の印刷
`private void`	`printMinMaxDivDelta()`	print max_min val
`private void`	`readParameterFile()`	Read Parameter File
`private void`	`readPointsFileAsParameterSet()`	入力pointsデータの呼び込み（１回目）パラメータファイルを呼び込むようになったので、データ確認程度 poinrtsファイルからmax min情報を取得
`private void`	`set_max_min_val(int i, double val)`	x_max,x_min..
`private void`	`setDelta()`	delta_x の設定

クラスから継承されたメソッド java.lang.Object
clone, equals, finalize, getClass, hashCode, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

- フィールドの詳細
  - isPointsSave
```
private boolean isPointsSave
```
  - isDistortionCalcurate
```
private boolean isDistortionCalcurate
```
  - isRatioCalcurate
```
private boolean isRatioCalcurate
```
  - infpath
```
private java.lang.String infpath
```
  - infname
```
private java.lang.String infname
```
  - inParameterFile
```
private java.lang.String inParameterFile
```
  - outfpath
```
private java.lang.String outfpath
```
  - outfname
```
private java.lang.String outfname
```
  - points
```
private sde.to.model.CTS[] points
```
  - badList
```
private CBadCellSampleList badList
```
  - points_header_line_no
```
private final int points_header_line_no
```
    関連項目:
    
    定数フィールド値
  - points_no
```
int points_no
```
  - Points_Header
```
private java.lang.String[] Points_Header
```
  - diff_x
```
private sde.to.model.CTS diff_x
```
    ポイント情報のx座標を格納する。diff_x.size()が　x-方向の点の数になる。
    使用するのは、readPointsFileAsParameterSet-＞ set_max_min_val , duv_x
  - diff_y
```
private sde.to.model.CTS diff_y
```
  - diff_z
```
private sde.to.model.CTS diff_z
```
  - delta_x
```
private double delta_x
```
    x-方向のセルの長さ= (max_x - min_x)/
  - delta_y
```
private double delta_y
```
  - delta_z
```
private double delta_z
```
  - pointsfile
```
java.io.File pointsfile
```
  - paramfile
```
java.io.File paramfile
```
  - reader
```
java.io.FileReader reader
```
  - buff
```
java.io.BufferedReader buff
```
  - writefile
```
java.io.PrintWriter writefile
```
  - alpha_val
```
private sde.to.model.CTS alpha_val
```
- コンストラクタの詳細
  - CSpider2
```
public CSpider2(java.lang.String infpath,
                java.lang.String infname,
                java.lang.String inParameterFile,
                java.lang.String outpath,
                java.lang.String outfname)
```
    コンストラクタ
    
    パラメータ:
    
    infpath - 入力ファイルパス
    
    infname - 入力ファイル名
    
    inParameterFile - パラメータファイル名
    
    outpath - 出力ファイルパス
    
    outfname - 出力ファイル名
  - CSpider2
```
CSpider2(double delta_x,
         double delta_y,
         double delta_z)
```
    CellPaire から　doExpansionを呼ぶ時に使用されるコンストラクタ
    
    パラメータ:
    
    delta_x - Δｘ
    
    delta_y - Δy
    
    delta_z - Δz
- メソッドの詳細
  - inFileOpen
```
void inFileOpen()
```
    入力ファイルのオープン
  - parameterFileOpen
```
void parameterFileOpen()
```
    パラメータファイルのオープン
  - outFileOpen
```
void outFileOpen()
```
    出力ファイルのオープン
  - set_max_min_val
```
private void set_max_min_val(int i,
                             double val)
```
    x_max,x_min.. の設定
    
    パラメータ:
    
    i - 0:x 1:y 2:z
    
    val - 値
  - parse3
```
org.apache.commons.math3.linear.RealVector parse3(java.lang.String oneline)
```
    oneline = (px,py,pz)の読み込み
    上の形でないときにはnullを返す。
    
    パラメータ:
    
    oneline - 一行入力値
    
    戻り値:
    
    点情報（３次元）またはnullをかえす。
  - parseOrigin
```
void parseOrigin(java.lang.String oneline)
```
    oneline = p0:(px,py,pz)の読み込み
    上の形でないときにはnullを返す。
    
    パラメータ:
    
    oneline - 一行入力値
  - parseCuboid
```
void parseCuboid(java.lang.String oneline)
```
    oneline = cuboid:(px,py,pz)の読み込み
    上の形でないときにはnullを返す。
    
    パラメータ:
    
    oneline - cuboidの設定
  - parseValue
```
private boolean parseValue(java.lang.String oneline)
```
    oneline = xx:実数の読み込み
    xx gamma1 or gamma2 or beta or minX or maxX or minY or maxY or minZ or maxZ
    or divX or divY or divZ
    上の形でないときにはfalseを返す。
    
    パラメータ:
    
    oneline - 入力実数値
    
    戻り値:
    
    true;
  - changeCuvoid
```
private void changeCuvoid()
```
    xCoreRatioが設定されている場合
    Cu = max {|min - p0|_max , |max - p0|_max}
    Cuboid_.x = Cu * xCoreRatio
    Cuboid_.y = Cu
    Cuboid_.z = Cu
    CPA.cuboid=Cuboid_
  - parsePointNo
```
int parsePointNo(java.lang.String oneline)
```
    点数
    上の形でないときは-1をかえす。
    
    パラメータ:
    
    oneline - 一行情報
    
    戻り値:
    
    pointsファイルに記述された点の数　ないときは-1
  - pointsReadWrite
```
private void pointsReadWrite()
                      throws java.io.IOException
```
    ポイントデータの入力
    拡張処理
    ポイントデータの出力
    Spider2 メイン処理
    
    例外:
    
    java.io.IOException - ファイルオープンエラー
  - max_abs
```
private double max_abs(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    |p|_max = max(|x|,|y|,|z|)
    
    パラメータ:
    
    p - point data
    
    戻り値:
    
    |p|_max
  - expansionRate_linea
```
private double expansionRate_linea(double x)
```
    拡大率の計算オリジナル
    
    パラメータ:
    
    x - 正規化された点の評価値
    
    戻り値:
    
    　α(x) 値
  - expansionRate2
```
private double expansionRate2(double x)
```
    拡大率の計算　２次曲線　2021.05.04
    
    パラメータ:
    
    x - 正規化された点の評価値
    
    戻り値:
    
    α(x) 値
  - getExpansionFactor
```
private double getExpansionFactor(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    拡張係数のみを計算する。
    
    パラメータ:
    
    p - 点情報
    
    戻り値:
    
    拡張係数(alpha
  - doExpansion
```
Cell doExpansion(Cell cell)
```
    Cellの拡張　蜘蛛の巣処理 CellPairで使用
    
    パラメータ:
    
    cell - 拡張対象
    
    戻り値:
    
    拡張後のセル
  - doExpansion
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector doExpansion(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    pointの拡張　蜘蛛の巣処理
    原点とのオフセット・正規化、拡張係数による拡大、
    正規化の戻し＋原点のリセット
    β(|(p-p0)/cuboid|max) ((p-p0)/cuboid)+p0
    
    パラメータ:
    
    p - 対象点
    
    戻り値:
    
    拡張点
  - getMinValueP_P0DividedByCuboid
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector getMinValueP_P0DividedByCuboid()
```
    p_p0|x/cuboid_x ...の最小値を求める
    
    戻り値:
    
    p_p0/cuboidの最小値
  - getMaxValueP_P0DividedByCuboid
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector getMaxValueP_P0DividedByCuboid()
```
    p_p0|x/cuboid_x ... の最大値を求める
    
    戻り値:
    
    p_p0/cuboidの最大値
  - expansionRate
```
private double expansionRate(double mx,
                             double x,
                             int id)
```
    x-方向の拡大係数 α_xを計算する。
    p_p0/cuboid _x ＜ 0 のとき
    |p_p0/cuboid|_max ＞ |getMinValueP_P0DividedByCuboid(x)|であればｘ方向の倍率はα_x= α(|getMinValueP_P0DividedByCuboid(x)|)を用いる。
    それ以外は α_maxを用いる
    p_p0/cuboid_x ＞= 0のとき
    |p_p0/cuboid|_max ＞　|getMaxValueP_P0DividedByCuboid| であればｘ方向の倍率はα_x=α(|getMaxValueP_P0DividedByCuboid(x)|)を用いる。
    
    パラメータ:
    
    mx - |p_p0/cuboid|_max
    
    x - p-p0/cuboid|x|
    
    id - 0:x 1:y 2:z
    
    戻り値:
    
    α_x
  - doExpansionNoCube
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector doExpansionNoCube(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    pointの拡張（非立方体）
    p_p0/cuboid _x ＜ 0 のとき |p_p0/cuboid|_max ＞
    |getMinValueP_P0DividedByCuboid|であればｘ方向の倍率はα_xを用いる。
    p_p0/cuboid_x ＞= 0のとき |p_p0/cuboid|_max ＞ |getMaxValueP_P0DividedByCuboid|
    であればｘ方向の倍率はα_xを用いる。
    
    パラメータ:
    
    p - 対象点
    
    戻り値:
    
    拡張点
  - readPointsFileAsParameterSet
```
private void readPointsFileAsParameterSet()
                                   throws java.io.IOException
```
    入力pointsデータの呼び込み（１回目）
    パラメータファイルを呼び込むようになったので、
    データ確認程度
    poinrtsファイルからmax min情報を取得
    
    例外:
    
    java.io.IOException - ファイルオープンエラー
  - readParameterFile
```
private void readParameterFile()
                        throws java.io.IOException
```
    Read Parameter File
    
    例外:
    
    java.io.IOException - ファイルオープンエラー
  - checkParam
```
private void checkParam()
```
    パラメータの検証
  - setDelta
```
private void setDelta()
```
    delta_x の設定
  - print
```
void print(java.lang.String name,
           org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    print Point　点情報の印刷
    
    パラメータ:
    
    name - 名前
    
    p - 点
  - printMinMaxDivDelta
```
private void printMinMaxDivDelta()
```
    print max_min val
  - get3CellPoints
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector[] get3CellPoints(org.apache.commons.math3.linear.RealVector p)
```
    get3CellPoints
    
    パラメータ:
    
    p - corner point
    
    戻り値:
    
    他の3点　rtn[0] +delta_x ,rtn[1] +delta_y ,rtn[2]
  - get3dRealVector
```
private org.apache.commons.math3.linear.RealVector get3dRealVector(double x,
                                                                   double y,
                                                                   double z)
```
    getRealVector
    
    パラメータ:
    
    x - x-値
    
    y - y-値
    
    z - z-値
    
    戻り値:
    
    realvector(x,y,z)
  - doCalculateCellsDistortion
```
private void doCalculateCellsDistortion(java.lang.String badCellPointsFilePath)
```
    歪度を各点すべてに計算する。
    しきい値以上のセルは、badCellPointsFileに書き込む。
    
    パラメータ:
    
    badCellPointsFilePath - badCellPointsFilePathへのファイルパス
  - doCalculateCellsRatio
```
private void doCalculateCellsRatio(java.lang.String badCellPointsFilePath)
```
    歪度を各点すべてに計算する。
    しきい値以上のセルは、badCellPointsFileに書き込む。
    
    パラメータ:
    
    badCellPointsFilePath - badCellPointFileへのファイルパス
  - getPointFromKey
```
org.apache.commons.math3.linear.RealVector getPointFromKey(int key)
```
    distortion mapのkey 情報から点情報を返す。
    前提：min max情報および、diff情報が設定されていること。
    
    パラメータ:
    
    key - マップキー情報
    
    戻り値:
    
    点情報
  - getIdxFromKey
```
int[] getIdxFromKey(int key)
```
    key 情報から(i,j,k)情報を返す。
    前提：min max情報および、diff情報が設定されていること。
    
    パラメータ:
    
    key - マップキー情報
    
    戻り値:
    
    (i,j,k)
  - main
```
public static void main(java.lang.String[] arg)
```
    main
    
    パラメータ:
    
    arg - 設定しない

クラス CSpider2

フィールドの概要

コンストラクタの概要

メソッドの概要

クラスから継承されたメソッド java.lang.Object

フィールドの詳細

isPointsSave

isDistortionCalcurate

isRatioCalcurate

infpath

infname

inParameterFile

outfpath

outfname

points

badList

points_header_line_no

points_no

Points_Header

diff_x

diff_y

diff_z

delta_x

delta_y

delta_z

pointsfile

paramfile

reader

buff

writefile

alpha_val

コンストラクタの詳細

CSpider2

CSpider2

メソッドの詳細

inFileOpen

parameterFileOpen

outFileOpen

set_max_min_val

parse3

parseOrigin

parseCuboid

parseValue

changeCuvoid

parsePointNo

pointsReadWrite

max_abs

expansionRate_linea

expansionRate2

getExpansionFactor

doExpansion

doExpansion

getMinValueP_P0DividedByCuboid

getMaxValueP_P0DividedByCuboid

expansionRate

doExpansionNoCube

readPointsFileAsParameterSet

readParameterFile

checkParam

setDelta

print

printMinMaxDivDelta

get3CellPoints

get3dRealVector

doCalculateCellsDistortion

doCalculateCellsRatio

getPointFromKey

getIdxFromKey

main